「みらい」 MR08-05 光合成色素

最終更新日: 2018-09-13
: MR08-05
: Processed (DMO)-QCed
: 光合成色素
:
海洋 > 海洋化学 > クロロフィル
生物圏 > 海洋生態系 > プランクトン > 植物プランクトン
生物圏 > 生態系ダイナミクス > 生態系機能 > 光合成

データのご利用にあたって

PI (Principal Investigator) : 松本 和彦(海洋研究開発機構)
データ利用の制限については 注意事項 をご参照ください。
データの引用については 注意事項 をご参照ください。
機器名:
高速液体クロマトグラフィ ( - MR10-03 Leg2)
このreadmeは、MR08-05航海のHPLC分析で得られた光合成色素量データについて解説したものです。
以下に、採水、分析を行った装置や試薬に関する情報を示します。さらに詳細な情報が必要な場合にはクルーズレポートを
ご参照ください。

1)  鉛直採水           : ニスキン
2)  表面海水採取方法   : バケツ
3)  採水層             : 8層
4)  ろ過とろ紙         : 暗所でWhatman GF/F径47mmを用いた
5)  凍結乾燥           : ろ紙を-20℃で5時間凍結
6)  抽出試薬           : N,N-dimethylformamide (HPLC-grade)
7)  抽出時間           : -20℃で24時間以上
8)  抽出試料の保存期間 : 数日間
9)  分析場所           : みらい
10) 分析機器名         : 高速液体クロマトグラフィ (HPLC)
11) 固定相             : YMC C8(逆相カラム), 150×4.6mm, 25℃
12) 移動相: (体積比)
溶離液A     methanol : acetonitrile : aquepus pyridin (0.25M pyridine) = 50 : 25 : 25
溶離液B     acetonitrile : acetone = 80 : 20
13) 測定色素           : 26種類 (詳細はcruise reportを参照して下さい)
高速液体クロマトグラフィ (HPLC: High Performance Liquid Chromatography) は、固定相 (カラム) 内の充填材との
親和力の差を利用して多種多様な成分を含む混合試料を成分毎に高速度で分離・特定・定量する装置です。
キャリアー (移動相) を高圧に加圧することによって、分離能・検出感度を高くしています。
現在「みらい」では、HPLCを海水中の植物プランクトンが有する各種色素を分離・定量するために使用しています。
各種色素を測定することにより、植物プランクトン群集の分類上の組成を推定することが可能です。
本航海では、Zapata et al. (2000) の手法をもとに、固定相にC8カラム (逆相カラム) を、移動相にピリジンを使用しています。
C8カラムはC18カラムよりも色素の分離度が高いことが特徴です。加えて移動相にピリジンを使用することで、
植物プランクトンのもつ多様なカロテノイドやクロロフィルといった色素類を高分解能に分離することができます。
装置はポンプ、ポンプコントローラー、オートサンプラー、PDA検出器、蛍光検出器、カラムヒーター、
制御パソコン及びプリンターから構成されています。

装置の概要図は以下を参照してください
PDFファイル
会社名 :           Waters co.
形式 :             Waters 616 (ポンプ)
                   waters 600S (ポンプコントローラー)
                   waters 717plus (オートサンプラー)
                   waters 996 (PDA検出器)
                   waters 474 (蛍光検出器)
                   waters N62009 (カラムヒーター)
                   COMPAC DESKPRO (制御PC)
PDA検出器の光学分解能と測定波長範囲:2.4nm,350〜720nm 
色素検出と識別
Divinyl Chlorophyll a, Chlorophyll a            : 661.4nm→赤色極大吸収帯を検出
Chlorophyllide a, Pheophorbide a, Pheophytin a  : 663.9nm→赤色極大吸収帯を検出
Chlorophyll b                                   : 457.2nm→赤色極大吸収帯を検出
[3,8-Divinyl]-Protochlorophyllide               : 440.0nm→赤色極大吸収帯を検出
Others                                          : 460.0nm→赤色極大吸収帯を検出
制御およびデータ処理ソフト : Millennium32 (Waters CO. Ltd.)
互換性 :                     Windows 98 Second edition
Chlorophyll a : Sigma-Aldrich Co.
Chlorophyll b : Sigma-Aldrich Co.
Other 23 pigments : DHI co.
trans-β-Apo-8'-carotenal (Internal standard) : Sigma-Aldrich Co.
Zapata, M., Rodriguez, F. and Garrido, J. L. (2000)
Separation of chlorophylls and carotenoids from marine phytoplankton: a new HPLC meted using a reversed
phase C8 column and pyridine-containing mobile phases. Mar. Ecol. Prog. Ser., 195, 29-45.
クルーズレポートの光合成色素の章において、標準物質の表記に誤りがありました。
詳細はレポート挿入の正誤表をご参照ください。
: MR08-05
: Processed (DMO)-QCed
: 光合成色素
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観測位置

Imagery reproduced from ...

データリスト

  ファイル名
MR08-05_HPLC.csv
: MR08-05
: Processed (DMO)-QCed

光合成色素データシートフォーマット

    MR08-05航海のHPLC分析で得られた光合成色素量データシートのフォーマット情報です。
    データ取得のないカラムは-9としました。

    MR08-05_HPLCに示されたカラムと項目名および説明を記します。

    カラム番号項目名説明
    1CruiseID航海ID
    2STNNBR測点番号 (cruise reportのCTD cast tableに基づく)
    3CASTNOCTDキャスト番号 (cruise reportのCTD cast tableに基づく)
    4UTC Date採水開始日 (cruise reportのCTD cast tableに基づく)
    5UTC Time採水開始時刻 (cruise reportのCTD cast tableに基づく)
    6Latitude採水開始緯度 (北緯:cruise reportのCTD cast tableに基づく)
    7Longitude採水開始経度 (東経:cruise reportのCTD cast tableに基づく)
    8BTLNBR採水したニスキンボトルの番号
    9BTLNBR_FLAG_W採水したニスキンボトルのフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    10CTD DepthCTD採水した深度 (m)
    11CTD PRSCTD採水した圧力 (dbar)
    12CTDPRS_FLAG_WCTD採水した圧力のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    13CHLHPLCChlorophyll a 現存量 (mg/m3)
    14CHLHPLC_FLAG_WChlorophyll a 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    15CHLC3Chlorophyll c3 現存量 (mg/m3)
    16CHLC3_FLAG_WChlorophyll c3 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    17CHLIDEAChlorophyllide a 現存量 (mg/m3)
    18CHLIDEA_FLAG_WChlorophyllide a 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    19MGDVP[3,8-Divinyl]-Protochlorophyllide 現存量 (mg/m3)
    20MGDVP_FLAG_W[3,8-Divinyl]-Protochlorophyllide 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    21CHLC2Chlorophyll c2 現存量 (mg/m3)
    22CHLC2_FLAG_WChlorophyll c2 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    23PERIDPeridinin 現存量 (mg/m3)
    24PERID_FLAG_WPeridinin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    25PHIDEAPheophorbide a 現存量 (mg/m3)
    26PHIDEA_FLAG_WPheophorbide a 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    27BUTFUCO19'-butanoyloxyfucoxanthin 現存量 (mg/m3)
    28BUTFUCO_FLAG_W19'-butanoyloxyfucoxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    29FUCOFucoxanthin 現存量 (mg/m3)
    30FUCO_FLAG_WFucoxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    31NEONeoxanthin 現存量 (mg/m3)
    32NEO_FLAG_WNeoxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    33PRASPrasinoxanthin 現存量 (mg/m3)
    34PRAS_FLAG_WPrasinoxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    35HEXFUCO19'-hexanoyloxyfucoxanthin 現存量 (mg/m3)
    36HEXFUCO_FLAG_W19'-hexanoyloxyfucoxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    37VIOLAViolaxanthin 現存量 (mg/m3)
    38VIOLA_FLAG_WViolaxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    39DIADINODiadinoxanthin 現存量 (mg/m3)
    40DIADINO_FLAG_WDiadinoxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    41ANTHAntheraxanthin 現存量 (mg/m3)
    42ANTH_FLAG_WAntheraxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    43ALLOAlloxanthin 現存量 (mg/m3)
    44ALLO_FLAG_WAlloxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    45DIATODiatoxanthin 現存量 (mg/m3)
    46DIATO_FLAG_WDiatoxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    47ZEAZeaxanthin 現存量 (mg/m3)
    48ZEA_FLAG_WZeaxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    49LUTLutein 現存量 (mg/m3)
    50LUT_FLAG_WLutein 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    51CROCOCrocoxanthin 現存量 (mg/m3)
    52CROCO_FLAG_WCrocoxanthin 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    53CHLBChlorophyll b 現存量 (mg/m3)
    54CHLB_FLAG_WChlorophyll b 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    55DCHLADivinyl Chlorophyll a 現存量(mg/m3)
    56DCHLA_FLAG_WDivinyl Chlorophyll a 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    57PHYTINAPheophytin a 現存量 (mg/m3)
    58PHYTINA_FLAG_WPheophytin a 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    59ALPHACAlpha-carotene 現存量 (mg/m3)
    60ALPHAC_FLAG_WAlpha-carotene 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    61BETACBeta-carotene 現存量 (mg/m3)
    62BETAC_FLAG_WBeta-carotene 現存量のフラグ (フラグ詳細は品質管理フラグをご参照ください)
    63Remarks測点名の記載
: MR08-05
: Processed (DMO)-QCed
データの品質管理について以下のようにフラグを付与しました。

関連情報

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