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地理情報およびデータフォーマットの品質管理ツール

データ検証と品質管理のサービスはLifeWatchポータルhttp://www.lifewatch.be/data-servicesで利用できます。

地理的サービス

このサービスではファイルをアップロードし、地図上にプロットすることができます。このwebサービスを利用するのにGISの知識は必要ありません。このサービスでは、場所を視覚的に確認でき、簡単にポイントを特定し、また、ポイントが調査域あるいは対象域の外にないかや、陸地の上にないかを確認することが出来ます。OBISにとって地理データは重要ですが、経験上、それらのデータは不完全であるか、エラーを含むことが多々あります。サンプリング地点を視覚的に確認することは明らかなエラーを取り除き、データ品質を改善する簡単な方法です。緯度および経度はWGS84の十進形式である必要があります。この形式はOBISスキーマとして必須であり、IPTにデータセットをアップロードするためにも必要です。

OBISデータフォーマット検証サービス

OBISのデータフォーマット検証はOBISスキーマに従った構造のデータに対して利用できます。この検証サービスは以下の項目をチェックします。

  • 全ての必須項目が埋まっているか？抜けている項目は何か？
  • 座標は正しいフォーマットか (十進法の度表記であるか？度が取り得る最小と最大の値に収まっているか？) ？
  • サンプリングポイントが陸または海にあるか？
  • 日項目の情報は有効値か (例えば月が1-12の間にあるか) ？
  • 分類群名がWoRMSと適合するか

このツールはいくつかを同時に実行します。最初のステップで、ユーザーのデータのヘッダー部分とOBISスキーマで使われている項目名を紐付けます。そして、ユーザーがフォーマット検証を実行すると、以下のチェックが行われます。

  • OBISスキーマにおける必須項目のチェック。必須項目が空である場合、それらは個別にリストアップされ、ユーザーはその項目を埋めることが出来ます。それらの項目が空白の場合OBISノードはデータセットを受け入れることが出来ません。
  • ユーザーファイルに含まれるすべてのOBISスキーマ任意項目のリストアップ
  • いくつかの項目の内容の検証
  • 緯度・経度：
    • 値が世界空間の中に収まっているか？
    • 値が0ではないか？
    • 値が海洋環境 (海/海洋) にあるか (=海洋のデータセットという必須条件) ？
  • データ関連項目：
    • 年-月-日は有効な日付か？
    • 開始および終了日付が有効な日付か
  • 学名：
    • 学名がWoRMSに登録されているか？
    • 「はい」の場合
      • 分類群が海産であるか、否か
      • 分類群が有効か、否か
      • 分類階級

WoRMSとの照合のあと、以下の概要を含むレポートが得られます

  • 完全に適合した数
  • ファジーマッチで適合した数
  • 適合しなかった数
  • マッチング中に発生したエラーの数

上記の各段階に対して、チェックを通過したレコードの数はレポートに表記されます。ツールはそれらの結果の総合計を算出し、上記の各チェックの結果に基づいて、レコードの品質がOBISに取り込まれるのに十分であるかを表示します。

ユーザのファイルがOBISスキーマに適合していない場合、それらも同様に表示されます。OBISスキーマに紐付けることが出来ない項目はOBISにアップロードされません。

データフォーマットチェックののち、最初にアップロードしたファイルにいくつかの項目が付け加えられ、上記の各ステップのチェックの結果が表記されます。それぞれのチェックは基本的にyes/noであり、ファイルにおいては1 (yes) 、0 (no) に変換されています

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