Monitoring of deep-sea fish diversity using environmental DNA metabarcoding of pumped deep-sea water in Sagami and Suruga Bays, Japan
概要
このデータベースでは、深層水より得られる深海性魚類の環境DNAについて扱います。深層水は、駿河湾焼津沖水深400mおよび相模湾赤沢沖水深811mにある取水口より採水されたものを分析しました。次世代シーケンスにより得られたデータをMioFishと照合し、全リード数の3%以上検出される種について列挙しました。
引用方法
Tsuchida, S., M. Kawato, T. Yoshida, Y. Fujiwara, Y. Nagano, and A. Yabuki. (2021) Monitoring of deep-sea fish diversity using environmental DNA metabarcoding of pumped deep-sea water in Sagami and Suruga Bays, Japan. Available at https://doi.org/10.48518/00005. Accessed on yyyy-mm-dd.
文献情報
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Kawato, M., Yoshida, T., Miya, M., Tsuchida, S., Nagano, Y., Nomura, M., Yabuki, A., Fujiwara, Y. & Fujikura, K. (2021). Optimization of environmental DNA extraction and amplification methods for metabarcoding of deep-sea fish. MethodsX, 101238. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2215016121000315
URL
ライセンス
連絡先
土田 真二Resource Contact、Resource Creator、Metadata Provider
組織名 : 海洋研究開発機構電話番号 : +81-46-867-9558住所 : 237-0061 日本 神奈川県 横須賀市 夏島町2-15ホームページ : Eメール : tsuchidas@jamstec.go.jp
データセット、データ提供機関・提供者 :
JAMSTEC
生物出現レコード　概要
生物出現レコード　→
[地図・概要]
■レコード数
48件
■レコード取得期間
2019/09/25 ~ 2019/09/26
* データの最終更新日 : 2021/03/09
■レコード取得範囲
緯度
34.83885333 ~ 34.8532
経度
138.3573167 ~ 139.1364983
水深
400 ~ 811 m
[環境情報]
[登録されている分類群情報]
■分類群数
32分類群
■種数
32種
Taxon level lower than family :100 %
Taxon level lower than species :100 %
学名一覧
表示件数/ページ
出現レコードダウンロード
こちら
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